番木瓜一般用塑料营养袋育苗，营养袋的规格为高20厘米，宽15厘米。营养土的成分是9份塘泥、1份腐熟禽畜粪，充分混合后装入营养袋，每袋放入2～3粒番木瓜种子。如果要节省种子，可先将种子置于32～35℃条件下保温保湿，进行催芽处理，发芽后每个营养袋放1粒种子。一般播种不宜太深，播种后覆上一层泥土即可。当种子苗出土后，可以再覆上一层垃圾及腐熟猪牛粪混合的肥土，并保持土壤湿润，喷300倍胶体硫，每隔10天喷1次，共喷2～3次，以减少病害的发生。当出现2～3片真叶后，适当减少淋水次数，促根深生，每10天施1次水肥，如腐熟的稀释10倍的尿水。

由于在秋冬进行育苗，所以要做好防寒工作，一般盖塑料薄膜防寒，要求棚内温度不高于35℃，不低于5℃。白天温度过高时，要掀起薄膜，以便接收阳光和散热降温，晚上盖好防寒。当幼苗长出5片真叶，同时夜温不低于8℃时，要注意炼苗，也即逐渐打开薄膜，少施肥少淋水，这样，使苗木矮壮、根系发达。当苗高达20厘米左右，就可以出圃进行大田定植。

优良的番木瓜新品种具有早结、丰产、优质、抗病的特点。然而，一个优良的品种，必须具备优良的栽培方法，即所谓良种良法，才能充分发挥品种原有的特点和特性，培育老、矮、壮苗就是它的基础。

所谓老、矮、壮苗，其标准为：老，即保证有130～150天的苗期，叶片在13～15片以上，叶片厚而淡绿色；矮，即苗高在20～25厘米以下，节密，株高小于宽度(株冠直径)；壮，即茎秆粗壮，叶柄粗而坚挺，叶腋有侧芽，根系发达，透过营养杯可见发达、粗壮的白根，这时两片子叶仍没脱落。