超级杂交水稻计划是1996年提出的，由“杂交水稻之父”袁隆平主持培育计划。水稻超高产育种，是近20多年来不少国家和研究单位的重点项目。1996年，农业部立项中国超级稻育种计划，其中一季杂交稻的产量指标为，第一期亩产700公斤，第二期亩产800公斤。

2000年，超级杂交水稻品种达到了第一阶段单次水稻产量标准即每公顷产量超过了10.5吨；2004年超级杂交水稻达到第二期产量指标；2012年9月24日，湖南省农业厅组织的专家验收组宣布超级杂交稻第三期大面积亩产900公斤攻关的圆满实现。

水稻超高产育种，是近20多年来不少国家和研究单位的重点项目。日本率先于1981年开展了水稻超高产育种，计划在15年内把水稻的产量提高50%。国际水稻研究所1989年启动了“超级稻”育种计划，要求2000年育成产量比当时最高品种高20%—25%的超级稻。但他们的计划至今未实现。

被称为“杂交水稻之父”的中国工程院院士袁隆平介绍，2005年5月，他和同事们的努力集中在培育第二阶段的超级杂交水稻，并取得了良好的进展，其中最近开发出来的一些杂交水稻品种有每公顷13吨的潜力，最好的一个杂交水稻品种已连续两年都达到了每公顷12吨的水平。